Mit Ausnahme der Jugendspiele, bei denen Fahrnau unter der Regie von Anton Biedermann 1941 die Bannmeisterschaft errang, ruhte die allgemeine Vereinstätigkeit während des Krieges.

Der 2. Wetltkrieg hatte auch vom FV Fahrnau große Opfer gefordert. In tiefer Ehrfurcht gedenken wir den 36 Mitgliedern, die die Heimat nicht wieder sahen.

Wenige Monate nach Kriegsende, bemühten sich einige Unentwegte, den Spielbetrieb wieder anzuregen. Nachdem von Seiten der Militärregierung der Besatzungsmacht gegen den Fußballsport keine Einwände bestanden, im Gegensatz zum Turnen, Schießsport usw., wurde am 30. Juni 1946  die Gründungsversammlung der Sportfreunde Fahrnau im Gasthaus ”Zum Löwen”, durchgeführt.

Max Kuhn, Anton Biedermann, Emil Kneußlin, Kurt Mahler und Fritz Fehrenbach waren die Initiatoren, die von der Versammlung mit der Führung dieses Provisoriums beauftragt wurden.

Bald setzte wieder ein reger Spielbetrieb ein. Neben der Fußballmannschaft wurde auch eine Damen- und Herrenmannschaft im Handball gegründet. Die Fußballabteilung stieg für die Saison 1947/48 in die Landesliga, die Handballabteilung in die Bezirksliga auf. Diese Saison war für die Fußballer von Fahrnau wohl die schwierigste seit bestehen des Vereins. Die Schwierigkeiten lagen weniger in spielerischer Hinsicht. Vielmehr war es ein kaum lösbares Problem, Orte wie Baden-Baden, Ottenau, Villingen, Engen oder Stockach rechtzeitig zu erreichen und oftmals erst nach drei Tagen wieder heil zu Hause anzukommen. Bahn oder LKW (teils mit Holzvergaser), waren zu jener Zeit zuverlässige Transportmittel. Die notwendige Marschverpflegung für die Mitreisenden bettelte man im Ort zusammen. Kameradschaft und Opferbereitschaft, aber auch viel Mut gehörte dazu, unter solchen Schwierigkeiten dem Fußballsport zu dienen.

Die Zeit der Sportfreunde Fahrnau war nicht gerade die glücklichste. Die ewigen Rivalitäten zwischen den einzelnen Abteilungen, zahlten sich für die Fußballabteilung als finanziellem Träger der Dachorganisation, nicht aus. Nach Lockerungen der Bestimmungen der Militärregierung konnten die Sportfreunde Fahrnau nach fas vierjährigem Bestehen wieder in selbständige Vereine zurückgeführt werden.